Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa6P50704 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms