Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cav1P49817 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cav1P49817 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms