Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc3P49135 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc3P49135 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms