Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms