Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms