Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbx1P41778 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms