Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf2P39429 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms