Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms