Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Saa4P31532 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Saa4P31532 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Saa4P31532 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Saa4P31532 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms