Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms