Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxraP28700 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxraP28700 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxraP28700 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms