Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms