Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl3P27659 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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