Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms