Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms