Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo2P25801 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms