Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk11bP24788 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms