Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms