Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja1P23242 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms