Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RarbP22605 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RarbP22605 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RarbP22605 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RarbP22605 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RarbP22605 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RarbP22605 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RarbP22605 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms