Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SftpcP21841 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SftpcP21841 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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SftpcP21841 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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