Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klra1P20937 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klra1P20937 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms