Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcer1aP20489 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms