Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms