Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Csn1s1P19228 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms