Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RargP18911 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RargP18911 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RargP18911 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms