Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka1P18653 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms