Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcnaP17918 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms