Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatspereP0DP43 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms