Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms