Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd4P06332 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd4P06332 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms