Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01823 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01823 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01823 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms