Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01741 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01741 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01741 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01741 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01741 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01741 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01741 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01741 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms