Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcn1O88704 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms