Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp4O70480 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms