Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx7O70439 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx7O70439 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms