Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms