Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top3aO70157 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms