Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlx3O55144 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms