Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg2O55111 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg2O55111 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg2O55111 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg2O55111 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg2O55111 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg2O55111 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg2O55111 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms