Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cldn5O54942 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn5O54942 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms