Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms