Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CaluO35887 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CaluO35887 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CaluO35887 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaluO35887 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaluO35887 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms