Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Enc1O35709 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms