Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Opn1mwO35599 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1mwO35599 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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