Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Prrt1O35449 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Prrt1O35449 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Prrt1O35449 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Prrt1O35449 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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