Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna6O35345 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms