Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st1O35310 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st1O35310 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms