Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pitx3O35160 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms