Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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